Академия реализует программы дополнительного профессионального образования по направлениям повышения квалификации и профессиональной переподготовки руководителей и специалистов пищевых и перерабатывающих предприятий агропродовольственной сферы России и стран мира. Образовательные мероприятия проводят кафедры и центры технологического, экономического и инженерного направлений.

Кафедры технологического направления организуют и проводят обучение руководителей и специалистов (главных технологов, технологов, заведующих производственно-технологическими лабораториями и других). Кафедры экономического направления обучают руководителей предприятий, а также специалистов планово-экономической конъюнктуры, бухгалтерского учета и аудита и других. Кафедры инженерного направления обучают руководителей и специалистов инженерных подразделений предприятий и компаний, в том числе главных инженеров, главных энергетиков, главных механиков и т.д.  При кафедрах Академии организованы центры, занимающиеся образовательной и научно-исследовательской деятельностью по отдельным направлениям и отраслям, в том числе:

• Центр промышленной безопасности и охраны труда
• Центр международного сотрудничества
• Центр профессионального бухгалтера
• Центр промышленности строительных материалов
• Центр современного хлебопечения
• Центр соверменного производства кондитерских изделий
• Центр экспертизы промышленной безопасности технических устройств
• Центр современного производства комбикормов